Bem-vindo aos Clusters UFABC

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Introdução

Atualmente a UFABC possui dois clusters de alto desempenho em operação. São eles:

- Titânio
- Cobalto

O Cluster Cobalto foi formatado para que seu uso fique mais parecido com o Titânio.

Guia do usuário

Termo de Uso

Informações sobre o hardware

Citação

TODO

Acesso e uso

Instruções de acesso

Instruções gerais sobre o cluster (filas, diretórios, compiladores...)

Comandos nativos do gerenciador de processos (SLURM)

Comandos compatíveis do gerenciador de processos (PBS) - Semelhante a antiga Cobalto

Ferramentas para facilitar o envio de simulações

Rotinas de teste

Cluster Cobalto

Programas instalados

Para cada programa instalado são configurados alguns testes. Esses testes podem ser utilizados como exemplos básicos de scripts de envio. Eles estão disponíveis em /opt/ufabc/<programa>/tests.

Titanio
programa versão SMP MPI GPU
Clustal S N N
COPASI 4.15.95 N N N
Columbus 7.0 S S N
CPMD 3.17.1 S S N
DFTB+ 1.2.2 S N N
ELK 4.3.6 S S N
Gaussian 09 S S N
GCC 4.4.7 n/a n/a n/a
GCC 5.1.0 n/a n/a n/a
GLoBES 3.2.17 n/a n/a n/a
Gromacs 5.0.1 S S S
GSL 2.3 S - -
LAMMPS 16/01/2015 N S S
MCell 3.3 N N N
Metacomp (CFD++, Mime) 15.1/4.1 S S N
MrBayes 3.2.6 S S N
NAMD 2.10b1 S S S
Octave 4.0.0 S N N
Orca 4.0.1 N S* N
PETSc 3.5.3 N S N
Python 2.7.9
Quantum Espresso 5.1 N S N
QE Environ 5.1 N S N
R 3.4.0 S N N
root 5.34.36 S - -
Siesta 3.2.5 N S N
VASP 5.3 S
WANNIER 2.1.0 S
Cobalto
programa versão SMP MPI
GCC 4.4.7 n/a n/a
Gromacs 5.0.5 N S
LAMMPS 15/05/2015 N S
Python 2.6.6 n/a n/a
Quantum Espresso 5.1.2 N S

Exemplos

MPI

Suporte

Email

Titanio: dúvidas e solicitações podem ser enviadas para o email titanio.ufabc [at] gmail.com
Cobalto: abrir chamado no NTI, fila HPC.

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